Minst 14 personer har skadats i sammandrabbningarna som har ägt rum i ett fängelse, enligt myndigheten som meddelar det via meddelandetjänsten X (tidigare känt som Twitter).
På grund av dessa oroligheter har Ecuador utlyst ett nationellt nödläge och både polis och militär försöker återta kontrollen över fängelsekomplexet. Över 2 500 soldater sägs ha stormat fängelseområdet i Guayaquil.
I ett annat fängelse i staden Cuenca har fångar tagit ett 50-tal fångvaktare som gisslan.
Enligt president Guillermo Lasso innebär nödläget i alla Ecuadors fängelser att både polis och militär kan kallas in. Nödläget kommer att vara i kraft i 60 dagar. Beslutet fattades som en konsekvens av tidigare liknande incidenter, men mer begränsat nödläge, där borgmästaren i staden Manta blev skjuten till döds.
Inrikesminister Juan Zapata uppgav på tisdagen att säkerhetsstyrkorna hade återfått kontrollen över fängelserna i landet, men det fanns inga uppgifter om hur många fångvaktare som hade släppts efter förhandlingar.
Situationen i Ecuadors ofta överfulla fängelser anses vara mycket allvarlig. Upplopp, som oftast slutar med dödlig utgång, inträffar regelbundet när medlemmar från rivaliserande knarkligor strider mot varandra.
Fängelset i hamnstaden Guayaquil är konstruerat för att rymma 9 000 fångar, men det sägs att det för närvarande håller över 12 000 fångar.
