I den sjätte minuten gjorde Sembrant sitt första mål för Bayern München.
Efter en välslagen hörna nickade den svenska mittbacken distinkt in bollen i nätet.
Målet betydde 1–0 för laget och var Sembrants första sedan hon anslöt från Juventus i vintras.
Tretton minuter senare utökade Lea Schüller ledningen.
Med Magdalena Eriksson skadad har Linda Sembrant snabbt fått förtroende i den tyska storklubben.
Hon spelade hela förra ligamatchen mot Hoffenheim och fick på nytt förtroende från start mot Freiburg.
Bayern München vann med 4–0 och toppar den tyska högstaligan.
